Impulsó medidas neoliberales, en donde las estadísticas macroeconómicas indican un sostenido crecimiento en la economía peruana y una mayoritaria aprobación de las mismas.
- Promovió las inversiones en el sector minero y respaldó a las compañías instaladas en la década pasada.
- Se inauguró el Gaesoducto del Gas de Camisea.
- Se inició la contrucción de la Carretera Interoceánica Perú-Brasil.
- Lideró el proyecto de Comunidad Sudamericana de Naciones llamada hoy Unión de Naciones Suramericanas (UNASUR), comunidad política y económica integra por doce países independientes de Sudamérica. Se fundó el 8 de diciembre de 2004, en el templo inca del Coricancha, Cusco, Perú.
- Buscó nuevos mercados para las exporaciones agroindustriales y textiles, firmandoimportantes acuerdo comerciales con Mercosur, la Comunidad Andina y Tailandia.
- Se respetaron las normas constitucionales, la independencia de los poderes estatales y la libertad de expresión; pese a los casos de corrupción y escandalos políticos y por parte de su familia que rodearon al entorno presidencial y a importantes líderes del partido de gobierno.
- En el 2003 se emitió el Informe Final de la CVR que fijaba en 69.280 los asesinados y desaparecidos en esas dos décadas a manos de las fuerzas de la seguridad del Estado y, sobre todo, de Sendero Luminoso, considerado el principal violador de los Derechos Humanos con desenlace de muerte.
- El 21 de noviembre de 2003, pidió perdón en nombre del Estado a todas las víctimas de la violencia terrorista, toda vez que "la exclusión social, la falta de presencia del Estado y el abandono fueron el caldo de cultivo de la ideología demencial y terrorista que se ensañó con los peruanos más pobres". Además anunció una política de reparaciones colectivas en beneficio de las víctimas y sus familiares con un presupuesto de 2.845 millones de soles (817 millones de dólares).
- El 3 de noviembre del 2005 promulgó la Ley de Líneas de Base del Dominio Marítimo del Perú, que establecía un nuevo criterio de delimitación de las aguas territoriales del Pacífico. Esto fue inmediatamente rechazado por el gobierno chileno.
- Se aprobó el TLC (Tratado de Libre Comercio) con Estados Unidos, denominado por la legislación peruana Acuerdo de Promoción Comercial Perú-Estados Unidos (APC). Su propósito fundamental era eliminar las barreras al comercio de bienes y servicios, y estimular las inversiones privadas en los respectivos países. Al cabo de trece rondas de negociación, el APC quedó finiquitado el 7 de diciembre de 2005 y fue firmado en Washington por el ministro peruano del ramo, Alfredo Ferrero Díez Canseco, el 12 de abril de 2006 en presencia de Alejandro Toledo. El 28 de junio siguiente, a un mes justo del cambio de Administración, el Congreso peruano ratificó el acuerdo por 79 votos –incluidos los de la bancada aprista- contra 14, quedando pendiente su ratificación por el Congreso estadounidense y por ende su entrada en vigor.
